2015年12月1日，CNAS對實驗室等機構的標準、授權簽字人變更實施了備案管理制度。按照新的備案管理制度，獲認可6年及以上的機構，標準和/或授權簽字人在發生變更時只需提交《變更申請書》，由CNAS秘書處采取直接批準的方式，實行備案管理。備案管理制度實施后，CNAS既進一步提高了服務效率、增強了認可效果，又向認可對象釋放了改革紅利，激發了市場活力。
首先，增強了認可對象的主體責任意識，激發了市場主體活力。備案管理制度將“我審核，我批準”轉變為“你自評，我備案”，一進一退之間，凸顯了從業機構的主體責任。CNAS堅持“放管結合”，如果發現機構在自我評估中弄虛作假，將嚴格處理，撤銷該機構認可資格。
其次，縮短了工作時限，提高了認可服務效率。按照舊的管理方式，CNAS對標準及授權簽字人變更采取文審或現場評審的方式進行確認，文審方式通常需要20個工作日左右，如果采取現場評審的方式則需更長時間。備案管理制度實施以后，由機構直接提交《變更申請書》，CNAS秘書處根據申請完成備案即可，縮短了工作時限，提高了認可服務效率。
再次，減輕了認可對象的負擔 ,降低了認可成本。以往，CNAS秘書處安排評審員對機構的變更申請采取文審或現場評審進行確認，需根據人日數向機構收取評審費用。實行備案管理制度后，對獲得認可6年及以上的機構的變更申請不再收取費用，有效減輕了認可對象的負擔，同時也降低了認可成本。
備案管理制度在獲認可機構中廣受歡迎，自實施至今，CNAS秘書處已對50余家申請標準和/或授權簽字人變更的機構辦理了備案。2016年，圍繞鞏固深改成果的目標，CNAS還將從進一步提高服務效率、增強認可效果、夯實能力基礎三個方面著手，進一步解放思想，切實推進深化改革。
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